Le nouveau monastère de Philosophos, construit pour remplacer le précédent, d'époque byzantine, se situe dans la partie occidentale du canyon de Lousios et fut fondé au milieu du XVIIe siècle. Le catholicon (église principale) est une église à dôme en croix inscrite dans un carré, du type composite à quatre colonnes, avec des façades sobres et une décoration en brique médiocre. Les peintures murales à l'intérieur de l'église datent de 1663 et sont l'œuvre de Victor, un représentant de l'école crétoise. L'église possède également un impressionnant iconostase sculpté en bois.
Le nouveau catholicon fut construit par les moines du nouveau monastère et fut peint aux frais du pacha Mavraidis de Stemnitsa. Du milieu du XVIIe siècle au milieu du XVIIIe siècle, le nouveau monastère abrita l'école du clergé de Gortyne, fréquentée par d'éminentes personnalités de l'Église (par exemple, le patriarche Grégoire V). Entre 1834 et 1836, le monastère fut supprimé sur décision de la régence bavaroise, ses biens furent confisqués et vendus à des particuliers.
Aujourd'hui, le monastère est utilisé comme un couvent pour moines et est un département du monastère de Timios Prodromos (Saint Jean le Baptiste) à Stemnitsa.
De nombreux édifices religieux ont été situés dans les gorges du Lousios, y compris des églises, des monastères, des ermitages ainsi que des bâtiments profanes tels que des moulins à eau, des moulins à poudre noire, des manufactures de tabac, etc. Parmi les édifices religieux les plus importants figurent le Vieux Monastère de Panaghia (Notre-Dame) Philosophou, construit au Xe siècle, le Monastère de Timios Prodromos, datant de la fin du XVIe siècle, le Monastère d'Aimyalon, l'ancien et le nouveau monastère d'Atsicholos et Saint-André à Gortyne.
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